日常生活中常接触的菌有有益菌、条件致病菌、致病菌、腐生菌几类。
一、有益菌（日常接触/使用，对人体友好）
乳酸菌：酸奶、泡菜、益生菌制剂核心，肠道有益菌，抑制有害菌繁殖。
双歧杆菌：人体肠道原生有益菌，调节肠道菌群，常见于发酵食品，益生菌。
酵母菌：馒头、面包、酿酒的发酵菌，如干酵母，无致病性（除特殊致病性酵母）。
醋酸菌：酿醋核心菌，日常接触无危害。
枯草芽孢杆菌：益生菌、有机肥常见菌，环境中广泛存在，对人体无害。
二、条件致病菌（正常接触无害，免疫力低/接触过量会致病）
金黄色葡萄球菌：皮肤、手、毛巾、餐具表面，化脓性感染元凶（伤口/皮肤破损需注意）
大肠杆菌：肠道正常菌，粪便污染后会出现在水源，果蔬、餐具，致病性菌株会致腹泻。
铜绿假单胞菌：卫生间、拖把、水杯、加湿器潮湿处，易引起皮肤/眼部轻微感染。
白色念珠菌:口腔、皮肤、内衣表面，免疫力低时会引发鹅口疮、皮肤念珠菌病。
表皮葡萄球菌：人体皮肤表层常驻菌，伤口污染后可能引发局部感染。
三、致病菌（日常需避免接触，接触后易致病）
沙门氏菌：生肉、鸡蛋、未洗净的果蔬，致急性肠胃炎（呕吐、腹泻）
志贺氏菌：被污染的水源、食物、细菌性痢疾致病菌。
副溶血性弧菌：海鲜、凉拌菜，夏季高发肠胃感染。
溶血性链球菌：飞沫、皮肤接触，致咽炎、扁桃体炎，严重时引发风湿热。
李斯特菌：冷藏食品（酸奶、火腿、冷藏水果），对孕妇，老人、婴幼儿危害大。
四、腐生菌（不感染人体，仅致物品腐败，生活中随处可见）
霉菌：馒头、水果、蔬菜发霉的元凶（青霉、黑曲霉、根霉），产生的黄曲霉素有强致癌性。
变形杆菌：厨房、垃圾桶、污水中，致食物腐败，少数菌株会轻微致病。
放线菌：土壤、腐木中，产生土腥味，部分可产抗生素（如青霉素）